期刊編輯和同儕審查員如何做出決策
學術期刊在考慮的內容、喜歡的風格和呈現方式、使用的同行評審實踐以及決定發表或不發表論文的原因方面存在很大差異。然而，一般來說，我們希望對特定期刊範圍內的某個主題進行高品質的原創研究，並按照其指導方針和更廣泛的學術或科學標準清晰地呈現。為了確保發表的文章是真實的，信譽良好的期刊往往會對提交審議的學術或科學手稿應用多個級別的評估，並且會有幾個人（校對員、同行評審員，有時還有技術和行政人員）參與決定該手稿是否被接受並最終發表。
因此，任何期刊的決策過程都可能相當複雜，涉及許多單獨的程序，但由於每本期刊的決策過程略有不同，因此，最有用的可能是考慮同行評審的科學和學術期刊中進行的評估和後續決策的三個主要階段。第一階段包括技術和編輯篩選；第二是同儕審查過程本身；第三是評審報告的評估和最終的出版決定。
1. 同儕審查之前的技術和編輯篩選。
現在，每個月提交給學術和科學期刊的稿件數量如此之多，以至於嚴格的審稿前篩選已經成為減輕同儕審查員壓力的常態。初步篩選的重點是確保提交的手稿適合出版，因此值得同行評審。具體由誰來負責篩選或其中任何部分取決於特定的期刊及其工作人員。例如，接收線上提交的行政人員或技術助理可能會確保提交的所有文件完整無損，所有個人資訊均以正確的方式提供，並且手稿的任何部分都不會與已發表的文本有相似之處，從而構成抄襲。該人或與作者學科領域相關的研究生也可能會檢查稿件是否符合期刊作者指南，包括篇幅限制、論文結構組織、參考文獻類型、首選英文版本以及其他格式、文體和表達要求。學科專家或編輯甚至是期刊的主編可能會更仔細地查看手稿的內容，以確定研究主題在內容和重要性方面是否屬於期刊的範圍內，以及方法、結果和解釋是否有效且足夠原創以值得發表。作者寫作的清晰度和品質也可能受到一個或多個人的審查，因為糟糕的寫作無法準確地傳達複雜的研究。
這些檢查和其他可能的檢查究竟如何執行，以及如何根據這些檢查做出決定並與作者分享，這自然取決於誰在檢查和做出決定。因此，如果一篇論文明確報告了出色的研究成果，但卻沒有使用期刊指南中指出的結構或文獻格式，那麼它可能會立即被技術人員拒絕，而且沒有任何理由說明；而如果一篇論文涉及特別熱門的話題或編輯特別感興趣的問題，儘管存在明顯的語法錯誤，最終需要作者糾正，它仍然可能會被發送給審稿人。但可以肯定的是，在預審篩選過程中，拒稿可能來自各個角度，任何被認為低於期刊設定的內容、語言和格式品質門檻的文章都可能被拒稿。因此，作者在將作品提交給期刊之前，必須在整個手稿中準確、一致地遵循所有指南和說明，如果忽略了任何內容，則必須立即進行必要的更改。在這個初步篩選過程中，一封精心撰寫的求職信也非常有用，它解釋了這項研究的創新性和價值所在，以及為什麼報告這項研究的手稿非常適合該期刊及其讀者。
2. 同儕審查過程。
一旦稿件被認為值得審查，就會選擇並聯繫合格的同儕審查員（通常為兩到三名，但可能最多為六名）。審稿者必須具備評估作者研究所需的知識、技能、研究經驗和方法專業知識。通常會指派一名編輯來監督同儕審查過程，因此他或她會選擇這些專家，考慮作者報告的任何利益衝突，可能使用作者提供的建議，也可能與期刊中的其他校對員協商。期刊或個人編輯可能會向審稿人提供審閱稿件的具體說明，經驗豐富的審稿人通常也會有自己的清單，因此不可能確切地說出特定的同儕審查者會關注什麼或發現什麼亮點或問題。然而，作為研究領域或專業領域的專家，他們必然會關注研究的品質和意義、作者報告的清晰度和準確性，以及作者提供的解釋和意義的智力和實際影響。許多審查者關心的是參考文獻的準確性和全面性，以及研究資金和支持問題的清晰度，但論文的任何部分或方面都可能受到最嚴格的審查。標題、摘要、引言、方法和結果描述以及這些方法和發現的嚴謹性和有效性等突出元素將始終受到仔細審查，引用和引文、語法和專業術語或表格、圖表和其他圖形等視覺輔助工具也應受到仔細審查。如果事實、邏輯或程序上存在錯誤，審查者無疑會指出來；如果作者忽視討論並將其作品置於已發表的學術成果中，審稿人將要求其這樣做；如果作者在討論結果時進行的推測超出了手稿中報告的研究範圍，審稿人就會發出警告；如果審查人員錯過了抄襲案例，專家評審員通常會發現它們。
一般來說，同儕審查員更常對改進研究的書面陳述和討論相關事項進行評論，而不是對改進實際進行研究的方式相關事項進行評論，因此他們的許多批評將與有效陳述、描述和解釋的各個方面有關。除了詳細的評論和改進建議外，每位審稿人通常也會向編輯提供稿件的建議。在出版業飽和的環境下，不經重新考慮而直接拒絕稿件的建議十分常見，而且這些建議有時只給出一兩個主要原因，而不是詳細的改進建議。不做任何修改就接受是極為罕見的審稿人建議。大多數審查者建議在做出修改後重新考慮，無論這些修改是小修改（例如改變參考文獻的樣式、糾正拼寫和調整表格的設計）還是大修改（重新設計和重複研究將是重大的，就像完全重寫手稿以解決語言或結果解釋方面的重大問題一樣）。他們可能還建議在接受之前重新審查，特別是檢查重大缺陷或問題是否已修正。審查者的意見和判斷會對是否發表論文的最終決定產生重大影響，但同儕審查員實際上並沒有做出該決定。
3. 審稿報告的評估和最終發表決定。
監督同儕審查過程的編輯通常決定是否應拒絕稿件、在進行更改後重新考慮稿件或不加更改地接受稿件。在某些情況下，他或她可能會諮詢期刊的其他校對員或學科專家，並且主編通常會在與作者分享之前做出或至少批准最終的接受決定。與同儕審查員相比，編輯立即接受論文而不做任何修改的情況更為罕見，而且編輯決策過程實際上可能相當複雜。例如，為一篇手稿所選的審稿人對研究、研究價值和研究意義的看法可能有很大差異。由於使用多位審閱者的目的是獲得基於不同專業知識的個人意見，因此這是積極的，但這確實意味著，從一位審閱者的角度受到讚揚的手稿的某個方面很可能需要從另一位審閱者的角度進行修改。如果編輯要求作者修改，他或她可能會讓該作者制定修改方案，以解決所有審閱者的問題，但在許多情況下，編輯會透過優先考慮一位審閱者的觀點、引入其他審閱者以獲得新的觀點或向作者建議如何最好地解決衝突來解決嚴重的意見分歧。
儘管期刊編輯總是會非常認真地對待審稿人的意見和建議，但有時同儕審查者提供的報告可能不合適，這會帶來更具挑戰性的決定。例如，審閱者可能太匆忙，只做了粗略或不完整的工作。也許，編輯認為審查者的評論不正確，因為審查者不具備進行有效評估所需的知識或專業技能，或者審稿人的觀點明顯有偏見，或者這些評論明顯是出於個人野心。在這種情況下，編輯可能需要忽略整個審查報告或至少其中的大部分內容，並可能邀請新的審稿人或編輯同事提出進一步的意見。幾乎在每種情況下，負責稿件的編輯都會添加自己的評論和建議。這些回饋很可能與審查者提供的回饋有所不同，甚至可能有很大差異——除非編輯與作者有相同的專業，否則，編輯不太可能關注與專家審查者相同的問題。然而，編輯很可能會關心期刊的讀者群、每期可用的空間以及出版物的品質、影響力和持續成功的其他方面。手稿的長度以及所使用的語言可能是一個問題，特別是如果存在語法問題等，從而掩蓋或混淆作者的意思。可能會再次出現對期刊提供的結構、風格和文件指南的遵守情況，表格和圖形等視覺元素可能會被標記為重新設計或微調，並且可能會審查道德規範、報告標準和利益衝突等問題。
學術期刊的校對員經常會以他們的想法和改進建議讓作者感到驚訝，他們當然可以決定拒絕同行評審員希望他們接受的論文。事實上，編輯基於一位審稿人的建議而拒絕稿件的可能性遠高於基於同樣理由接受稿件的可能性，而且大多數編輯需要更多的接受建議才能做出積極的決定，而不是需要拒絕建議才能做出消極的決定。他們的決定也可能變得曠日持久，作者被要求多次修改他們的作品以供重新考慮，甚至可能由相同或新的同行評審員重新審查。儘管修改請求意味著稿件有可能在期刊上發表，而且與尚未開始審查和修改週期的稿件相比，編輯可能更不願意拒絕該稿件，但這並不意味著該論文已經可以發表，因此，編輯在流程的任何階段，甚至是最後的主編都可以決定拒絕稿件。例如，經過一輪修改和重新審查後，仍需要進行重大修改，這通常意味著稿件注定會被拒，但如果這是最終結果，那麼作者通常會非常清楚地了解原因，作者可以利用這些寶貴的反饋來改進論文，然後再將其提交到其他地方進行新的審查和決定。另一方面，如果作者的辛勤工作使論文被接受，那麼在稿件進入製作階段、編輯和排版階段時，期刊的其他工作人員就會開始做出決定。
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